在医药工业洁净厂房空调带转轮热回收装置的工程设计中，需结合工程项目的实际情况在设计中注意到以下几点：
1）根据车间的防火、防爆、防腐蚀等生产性质，在空调设备订货时提出不同的要求，例如对于甲类生产车间，要求空调机组及与之配套的阀门、仪表等均采用防爆型；对于有排烟和事故通风要求的车间，切不可前篇一律的用空调机组兼做排烟或事故排风，而要经过技术经济比较选择合理的方案；对于生产工艺中散发大量酸性、碱性或腐蚀性气体、液体的车间，对空调机组要进行防腐要求，通风管道要选择合适的管材；对于设置于室外或屋面的空调设备，需要做好防腐、防雨和保温措施。
2）根据车间生产的产品有无洁净度要求，在空调设备订货时提出不同的送风过滤功能。例如对于普通的生产车间，空调机组新风段后只需要进行一道粗效过滤；二对于有洁净度要求的洁净区，新风段后需要一道粗效过滤，转轮换热后需要一道中效过滤，在送风机均流段后还需要一道中效过滤才能把空气送入室内，以便有效的保护末端高效送风口。
3）根据车间生产过程中有无大量粉尘或热湿气体等，在空调设备订货时提出不同的排风过滤功能。例如对于普通的生产车间，空调机组回收前排风段后只需要进行一道粗效过滤；对于散发热湿气体的房间，空调机组热回收前排风段后需要进行一道中效过滤；而对于散发粉尘的房间应根据粉尘散发量分别考虑；若是散发微量的粉尘则空调机组热回收前排风段后就需要进行高效过滤以便除尘并且有效的保护热回收段；若是是散发大量粉尘的系统则应考虑到仅采用高效过滤不足以除去所有粉尘，长期有粉尘经过热回收转轮既会减少使用寿命且在热回收过程中不可避免的有粉尘送风进入洁净区，并且经常性的更换过滤段还会大大增加设备造价，所有不建议对散发大量粉尘的洁净区进行排风热回收。
4）根据车间生产过程中室内温、湿度的控制要求和厂区的冷热源情况，在空调设备订货时提出不同的表冷、加热、加湿功能，以及采用显热还是全热回收型转轮。
5）空调机组功能段组成有多样性，一般都是把送风机设置在热回收段及表冷、加热、加湿等功能段后面，而排风机就有不同的设置方式，可根据实际的工程项目和合适的进风、排风方式选择不同的风机设置位置和出风口方式。
6）对于有消毒要求的洁净空调系统，可在空调机组订货时提出在新风段上加设一个消毒用的风口或在空调机组内部增加消毒功能段（内置消毒液发生器）。
7）由于转轮热回收装置的结果特性，在热回收器后不可避免的会有部分排风进入送风系统，对排风污染有要求的工程就要进行特殊处理，比如在转轮上增设一段扇形结构以牺牲部分新风来减少排风混合等措施。而对于一些严格禁止排风污染的化学生产过程就不能盲目的坚持采用转轮热回收空调系统。
在医药工业空调系统设计中适当的应用带转轮热回收装置的设计是科学可行适用并具有一定的节能效益的。而在今后的医药工业项目中，既要保证医药工业通过GMP2010的验证，又要符合国家节能的相关要求，在这中间寻求一个合理的平衡，需要包括设计人员在内的所有人共同来参与研究探讨从而得出更多可行的方案措施。
